Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP10Q6VN20 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP10Q6VN20 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms