Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM1Q6UX27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM1Q6UX27 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM1Q6UX27 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms