Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SBSNQ6UWP8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBSNQ6UWP8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms