Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCLAT1Q6UWP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCLAT1Q6UWP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCLAT1Q6UWP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms