Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD1Q6UWL2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD1Q6UWL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD1Q6UWL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms