Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTA2Q6UW10 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms