Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD1Q6SPF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SAMD1Q6SPF0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SAMD1Q6SPF0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms