Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUX4L9Q6RFH8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms