Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L2Q6R6M4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L2Q6R6M4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L2Q6R6M4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L2Q6R6M4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms