Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF7Q6Q0C0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF7Q6Q0C0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF7Q6Q0C0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms