Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRFN4Q6PJG9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRFN4Q6PJG9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRFN4Q6PJG9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms