Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNV1Q6PIU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNV1Q6PIU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNV1Q6PIU1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNV1Q6PIU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms