Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF05

TTC23L, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23LQ6PF05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC23LQ6PF05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC23LQ6PF05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC23LQ6PF05 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms