Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMBQ6PCB8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms