Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLC3Q6P597 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLC3Q6P597 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLC3Q6P597 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLC3Q6P597 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLC3Q6P597 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLC3Q6P597 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLC3Q6P597 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms