Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P435 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P435 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P435 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P435 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P435 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P435 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P435 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6P435 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6P435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P435 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P435 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P435 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P435 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P435 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P435 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P435 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P435 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P435 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6P435 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6P435 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6P435 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6P435 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6P435 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6P435 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6P435 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6P435 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6P435 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms