Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3CQ6NXT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3CQ6NXT2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms