Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPAT2Q6NUI2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPAT2Q6NUI2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPAT2Q6NUI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPAT2Q6NUI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms