Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMBOX1Q6NT76 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBOX1Q6NT76 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBOX1Q6NT76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms