Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPH2Q6IBW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPH2Q6IBW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms