Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LGALS9CQ6DKI2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LGALS9CQ6DKI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms