Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPECC1LQ69YQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPECC1LQ69YQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPECC1LQ69YQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPECC1LQ69YQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms