Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CREB3L3Q68CJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms