Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNX4Q63HM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNX4Q63HM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms