Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMCO4Q5TGY1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO4Q5TGY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO4Q5TGY1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms