Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9C2Q5TAH2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9C2Q5TAH2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9C2Q5TAH2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC9C2Q5TAH2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms