Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf52Q5T4I8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf52Q5T4I8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms