Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF14Q5SWL7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF14Q5SWL7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms