Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LDLRAP1Q5SW96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LDLRAP1Q5SW96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms