Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM201Q5SNT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM201Q5SNT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM201Q5SNT2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms