Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC6Q5RKV6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC6Q5RKV6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms