Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1LQ5PSV4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms