Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A13Q5J8X5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A13Q5J8X5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms