Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
XKR4Q5GH76 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
XKR4Q5GH76 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XKR4Q5GH76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms