Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM61Q5EBN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM61Q5EBN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM61Q5EBN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM61Q5EBN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM61Q5EBN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM61Q5EBN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms