Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODF2Q5BJF6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODF2Q5BJF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms