Protein–RNA interactions for Protein: Q53LP3

SOWAHC, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOWAHCQ53LP3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOWAHCQ53LP3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOWAHCQ53LP3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOWAHCQ53LP3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms