Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHLDA2Q53GA4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHLDA2Q53GA4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms