Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC14Q49A88 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC14Q49A88 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC14Q49A88 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms