Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI54

KRTAP19-8, Keratin-associated protein 19-8, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-8Q3LI54 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
KRTAP19-8Q3LI54 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP19-8Q3LI54 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms