Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V0

MS4A18, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 18, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A18Q3C1V0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A18Q3C1V0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A18Q3C1V0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A18Q3C1V0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms