Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UVSSAQ2YD98 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UVSSAQ2YD98 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms