Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C17orf58Q2M2W7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C17orf58Q2M2W7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C17orf58Q2M2W7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C17orf58Q2M2W7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C17orf58Q2M2W7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C17orf58Q2M2W7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1217.7 ms