Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX7Q2KHR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX7Q2KHR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RFX7Q2KHR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX7Q2KHR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms