Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIST3H3Q16695 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST3H3Q16695 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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