Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP2Q16527 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRP2Q16527 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP2Q16527 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP2Q16527 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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