Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX1Q16384 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms