Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN9AQ15858 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN9AQ15858 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN9AQ15858 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN9AQ15858 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN9AQ15858 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
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