Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USF2Q15853 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USF2Q15853 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USF2Q15853 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USF2Q15853 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USF2Q15853 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USF2Q15853 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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