Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIP10Q15642 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP10Q15642 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP10Q15642 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP10Q15642 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIP10Q15642 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIP10Q15642 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIP10Q15642 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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